计算化学

计算机辅助药物设计平台

计算机辅助药物设计平台借助先进的建模和化学信息学软件,以及集群服务器和3D图形显示器等硬件设备,致力于为客户提供全方位计算机辅助药物设计的支持和服务,从而加速早期药物研发过程。

 

计算化学的服务包括:

 

  • 药物发现一体化服务
  • 虚拟筛选
  • 基于结构的药物设计
  • 基于配体的药物设计

药物发现一体化服务

计算机辅助药物设计平台使用生物信息学方法、计算化学方法及自主研发的基于深度学习的工具,为早期药物研发提供一体化服务,服务内容包括:靶点确证、苗头化合物识别、先导化学物的识别和优化等


  • 虚拟筛选

    利用计算软件筛选实体或虚拟化合物库,模拟目标靶点与候选药物之间的相互作用,计算两者之间的亲和力大小,以降低实际筛选化合物数目,同时提高苗头化合物发现效率。

     

    虚筛方法:

    • 基于分子对接
    • 基于药效团
    • 基于三维构象
    • 基于分子指纹

     

    化合物库:

    • WuXi HTS set (300K)
    • Mcule Purchasable (8.8M)
    • WuXi GalaXi virtual library (15B)
    • Enamine REAL virtual library (3.4B)

  • 基于结构的药物设计

    从蛋白质靶标的三维结构出发,以分子识别为基础,借助相关计算机软件,根据构效关系设计和优化化合物,进行合理药物设计,引导先导物的发现。


  • 基于配体的药物设计

    基于系列配体分子的药效三维结构、理化性质、药效基团模型及其构效关系等信息,进行的合理药物设计。